Awal berdirinya SMA Negeri 1 Habinsaran pada tahun 1984 adalah momen lahirnya ide mewujudkan kepedulian terhadap pendidikan secara umum dan pendidikan generasi muda di Habinsaran. Putera/i terbaik bangsa yang berasal dari Habinsaran sepakat membangun pendidikan di Bona Pasogit (tempat asal) dengan cara merekrut siswa terbaik dalam akademis dari setiap SLTP yang berada dalam jajaran wilayah Toba Samosir.

1. Periode 1984 s.d 1986               : Drs. Saut Halomoan Hutagaol
2. Periode 1986 s.d 1993               : Edward J. Hutapea
3. Periode 1993 s.d 2003               : Drs. Belsasar Panjaitan
4. Periode 2003 s.d Oktober 2003   : Drs Hasonangan
5. Periode 2003 s.d 2006               : Navia Tampubolon, S.Pd
6. Periode 2006 s.d 2009               : Sahat Pardosi, S.Pd
7. Periode 2009 s.d 2010               : Drs. Marusaha Pardosi
8. Periode 2010 s.d sekarang         : Togar D. Panjaitan, S.Pd., MSi.

Sejak TP. 1984/1985 sampai dengan sekarang SMA Negeri 1 Habinsaran menerima siswa baru melalui jalur seleksi sekolah.